Servisní laboratoř světelné mikroskopie

Pravidla pro přístup do laboratoře

  • Servisní laboratoř poskytuje otevřený nediskriminační přístup ke své instrumentaci a expertíze a je přístupná pro interní i externí uživatele.
  • Pro využití přístrojového vybavení a výpočetních kapacit Servisní laboratoře je nezbytná registrace. Registrace uživateli zpřístupní:
    • zařízení a služby Servisní laboratoře světelné mikroskopie v rezervačním systému IMG Calpendo
    • pracovní stanice pro ovládání mikroskopických systémů
    • pracovní stanice pro zpracování a analýzu dat. Tyto pracovní stanice slouží především pro interaktivní přístup k virtuálním pracovním stanicím.
    • virtuální pracovní stanice pro zpracování a analýzu dat (Virtual Desktop Infrastructure – VDI). Pracovní stanice jsou vybaveny širokou škálou otevřených i profesionálních softwarových balíků pro offline zpracování a analýzu obrazových dat a jsou uživatelům přístupné jak ze sítě IMG, tak i vzdáleně.
    • Huygens Remote Manager, který umožňuje konfiguraci úloh dekonvoluce obrazu a jejich dávkové zpracování na vyhrazeném serveru s výpočetním strojem Huygens Core a vysokým výkonem.
    • úložiště „VDI upload“ sloužící pro transientní uložení obrazových dat určených k nahrání na úložiště „VDI scratch“. Data uložená na „VDI upload“ jsou přístupná v režimu pro čtení i zápis ze sítě IMG i vzdáleně a nejsou zálohována.
    • úložiště „VDI scratch“ určené pro krátkodobé uložení živých pracovních dat a jejich zpracování s využitím virtuálních pracovních stanic. Data uložená na VDI scratch jsou přístupná v režimu pro čtení i zápis pouze z virtuálních pracovních stanic a nejsou zálohována.
    • úložiště „VDI data“ určené pro dlouhodobé ukládání obrazových dat. Data uložená na VDI data jsou přístupná v režimu pro čtení i zápis pouze z virtuálních pracovních stanic a jsou zálohována. Dlouhodobé ukládání dat na tomto úložišti je umožněno pouze interním uživatelům.
    • vzdálený přístup k úložištím VDI upload, VDI scratch a VDI data prostřednictvím služby Globus (node: vdi.img.cas.cz). Vzdálený přístup umožňuje stažení a nahraní dat na úložiště VDI infrastruktury.
    • s registrací do Servisní laboratoře může souviset zasílání automatických a jiných e-mailů týkajících se provozu Servisní laboratoře. Jejich odběr nelze odhlásit.
  • Noví externí uživatelé, kteří nemají zřízen IMG účet a přístup do rezervačního systému IMG Calpendo, se pro získání přístupu do servisní laboratoře musí registrovat prostřednictvím tohoto registračního formuláře. Bude jim založen uživatelský účet v systému pro správu identit uživatelů v síti img.cas.cz (IMG účet) a provedena registrace do servisní laboratoře.
  • Interní uživatelé a externí uživatelé, kteří již mají zřízen IMG účet a přístup do rezervačního systému IMG Calpendo se registrují do servisní laboratoře přímo v rezervačním systému, tak jak je popsáno v instrukcích pro registraci facility v rezervačním systému. Registraci může uživatel kdykoliv zrušit.
  • Mezinárodní uživatele prosíme o aplikaci prostřednictvím vstupního portálu Euro-BioImaging a při vyplňování návrhu přístupu kliknout na mapce na Česko a vybrat „Advanced Light and Electron Microscopy Node Prague CZ“ jehož jsme součástí. Více informací o přístupu prostřednictvím Euro-Bioimaging ERIC najdete zde.
  • Pokud si nejste jisti výběrem pracoviště, či dostupností příslušné technologie, můžete využít služeb vstupního portálu Czech-BioImaging anebo nás kontaktovat přímo.
  • Servisní laboratoř je součástí Národní infrastruktury pro biologické a medicínské zobrazování – Czech-BioImaging. Pracovníkům akademických institucí poskytuje možnost zvýhodněného přístupu na základě registrace projektu do programu „Czech-Bioimaging open access“. V průběhu poskytování služeb výzkumné infrastruktury Czech-Bioimaging, zejména v souvislosti s „open access“ přístupem, výukovými aktivitami a konferencemi, dochází k zpracování osobních údajů (Informace týkající se zpracování osobních údajů).
  • Využívání přístrojového vybavení je zpoplatněno viz aktuální Ceník.
  • Přístrojové vybavení je ve většině případů využíváno uživateli samostatně, bez asistence.
  • Aby mohl uživatel pracovat samostatně a vytvářet na daný přístroj neasistované rezervace, musí absolvovat všechna požadovaná školení. Školení jsou pravidelně organizována odpovědnými pracovníky laboratoře.
  • Během pracovní doby (8:00 – 18:00) jsou pracovníci servisní laboratoře k dispozici a na požádání poskytují asistence, technickou podporu či konzultace týkající se probíhajících/plánovaných experimentů.
  • Nabízíme také asistovaná měření pro krátké či jednorázové experimenty, a to pro nové uživatele nebo pro uživatele začínající s novou zobrazovací technikou.
  • Nabízíme možnost vyzkoušet si zdarma snímání pilotních experimentů, zejména takových, které využívají pokročilé či nově zaváděné zobrazovací techniky. Pokud si přejete využít tuto možnost, kontaktujte prosím pracovníky servisní laboratoře.
  • Externí uživatelé mohou požádat o přístup do servisní laboratoře i mimo hlavní pracovní dobu. Takový přístup je poskytován pouze zkušeným uživatelům a musí být schválen vedoucím servisní laboratoře. Pokud požadujete přístup do laboratoře mimo hlavní pracovní dobu a potřebujete IMG vstupní visačku, zašlete svoji žádost na helpdesk@img.cas.cz.

Ke stažení